干血斑样本用于HIV-1基因序列测定和亚型分析的研究
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2006年12月29日 中华流行病学杂志 2006 Vol.27 No.9 P.798-802
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（北京）为了将干血斑样本用于HIV-1基因序列测定和亚型分析。研究者采集20例静脉吸毒HIV-1感染者的EDTA抗凝静脉全血2 ml，80μl备干血斑样本。QIAamp Blood Mini试剂盒，10%Chelex(R)100树脂分别提取全血和干血斑中细胞DNA。HIV-1env基因Gp41区2对外侧和内侧引物，按照巢式PCR方法，扩增Gp41区，PCR产物用内侧正反向引物测序。MEGA 3.0等软件完成序列比对及亚型分析。结果 18对符合要求的干血斑和全血样本进入研究。16对经序列分析归为中国流行的BC重组亚型，样本间的基因平均离散率为5.79%，与中国流行的BC重组亚型的基因离散率为4.91%，与C亚型代表序列基因离散率为8.89%，与其他几个国际亚型代表株的基因离散率在15%～20%之间。另2对样本分别归属于泰国B'亚型和欧美B亚型。可见 干血斑样本与全血样本HIV-1 DNA PCR产物亚型分析一致，氨基酸序列比对同义和非同义替换比例、位置和类型基本一致，其易采集，便于运输，保存条件和生物危险性低，费用低廉的优点适合作为实验条件较差的偏远地区HIV-1分子流行病学研究的样本采集手段。
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