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中药指纹图普数据库建设应“提速”


发布:www.liulingling.com 来源:医学杂志

    中药指纹图谱使用的手段主要为光谱指纹图谱和色谱指纹图谱。DNA指纹图谱由于其特点,无法客观反映药用植物因外部环境影响基因表达造成的药效成分含量的差异,只能用于药材种质资源的考察。因此中药指纹图谱数据库主要储存色谱和光谱资料。当前,随着中药现代化的进程和国家有关规定的相继出台,指纹图谱实验已经大规模展开,但在些资料的保存和共享方面的研究已经滞后,建立共享的中药指纹图谱数据库的要求日益迫切。
    研究现状
    国内色谱数据库方面的研究以气相色谱保留指数方面的数据库居多,另有一些液相的色谱条件数据库方面的研究。储存原始色谱信号的数据库只有大连化学物理研究所进行了一些相关的研究尝试。
    国内在红外光谱数据库方面的研究较多,红外光谱数据库曾经作为我国的“七五“攻关课题进行研究。,国外已经有比较成熟的联机数据库建设,国内也有通过Internet提供的检索服务。
    虽然有关研究已经开展起来,但目前国内仅有吉林大学的何淑华等人使用红外光谱仪自带的光谱建库功能建立了中药对照药材的红外指纹图谱库;中国科学院院士卢佩章等设想在5-10年内建立以智能统一液相色谱法为基础的中药组成指纹数据库,以及直接用质谱、光谱等手段测定中药组成的数据库;大连化学物理研究所的王龙星等人使用Access数据库和VisualBasic设计了可以保存原始数据的色谱指纹图谱数据库,并收录了部分药材的气相和液相色谱信息。
    要求迫切
    进入21世纪以来,信息化的浪潮席卷全球。信息化的本质其实是信息资源的共享水平和利用水平不断提高的进程。信息资源的开发与利用是信息化的出发点和落脚点,而计算机化、网络化、化是信息资源开发与利用的基础设施,是信息化的工具和手段。
    目前在中药指纹图谱研究过程中,基本实现了计算机化和数字化,但是网络化的要求还远远没有达到。指纹图谱研究过程中产生了大量的科学资料,如果不建立有效的信息共享手段,必将造成指纹图谱资料的交叉重复采集,浪费人力、物力、财力。尽管初期的重复采集可能有一定的交叉验证效果,不同途径的探讨也是有必要的,但是,无目的的重复采集比之有组织、有计划的考察效率低多了。因此,对于那些没有或只有薄弱的数据采集能力,但却具有强大的资料分析能力的科研单位而言,对资料共享的要求就变得十分迫切。
    指纹图谱技术正处在不断发展和完善的过程中。指纹图谱的发展分为两个阶段,初级阶段应是确立指纹图谱的建立方法及相似度判定,高级阶段应进行指纹图谱特征和药效相关性研究、指纹图谱的生物等效性研究。高级阶段的工作要求进行资料积累,如果能从大量的资料中挖掘有效的信息,对研究的深度和广度都有巨大的推动作用。但是,任何一个研究单位可以积累的资料量都是有限的,有限的资料量容易导致对资料分析的片面性,进而在我们探索真理的道路上造成阻碍。此外,由于硬件损坏、病毒等原因常可导致存储在计算机中的资料丢失,造成巨大的损失。建立数据库并由专业人员负责维护,资料就能够得到较好的保护,因意外造成资料丢失的可能性也会大大降低。
    中药积累了几千年的实践经验,指纹图谱数据库的建立,使这种积累达到了前所未有的高度,使中药可以从一个更科学的角度积累数据。如果没有初级阶段的资料积累,也就谈不上高级阶段的资料加工分析;如果没有一个良好的资料积累机制,必将影响到中药指纹图谱的发展。因此,中药指纹图谱数据库建设的要求是紧迫的,其对中药指纹图谱技术的发展具有深远意义。
    目前,与指纹图谱实验技术研究相比,指纹图谱数据库的研究还相对薄弱,研究只是处在单机数据库阶段,尚没有考虑对药效学资料进行收集,对网络化的共享数据库方面尚缺乏系统性研究,资料的采集只是使用本单位或者是有一定合作关系的单位的实验资料。由此可见,中药指纹图谱数据库的研究已经滞后于中药指纹图谱技术的发展,应当加快中药指纹图谱共享数据库的建设速度、加大研究力度。
                     摘自:《中国医药报》文/乔善磊 

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