不同学者和不同地区所报告的旅游者腹泻，其病原组成也不相同。一般认为，其检出率依次为：产肠毒素性大肠杆菌(40%) ，沙门氏菌属和志贺菌(15%)，轮状病毒和微小病毒(10%)，贾第虫引起的腹泻机会远较阿米巴原虫为多，约30%旅游者腹泻的病因不明。
旅游者腹泻的发病机理及临床表现取决于病原的种类。腹泻发生的时间大多为抵达旅游地后3～7天，持续时间平均为3～5天。产肠毒素性大肠杆菌性腹泻常无发热和严重腹痛，但排便频繁，呈水样，可有呕吐和失水。病毒性腹泻的大便呈水样，缺乏特征性。贾第虫腹泻者的潜伏期为1～3周，病程可长达2周以上。沙门氏菌和志贺氏菌感染时，粪便中可见较多白细胞和脓细胞。
一部分活动受到明显的影响，故对旅游者腹泻除一般治疗外，应根据可能病原进行相应的治疗。有效的抗菌药物有复方新诺明、强力霉素及氟喹诺酮类抗生素(如氟哌酸、氟啶酸、氟嗪酸、环丙氟哌酸等)。
对于贾第虫和阿米巴原虫感染大多采用甲硝唑治疗，剂量为每次750mg，每天3次，疗程7～10 天。
外出旅游者预防腹泻的发生，除应注意饮食与饮水外，还应预防性地服用一些抗菌药，如强力霉素、红霉素、复方新诺明等，其有效率可达80%，但应注意小量服用，以防肠道菌群失调和耐药菌株产生。
