男性胎儿在母体发育时，其睾丸的下降过程发生障碍，“抛锚”于下降途中，阴囊里找不到睾丸，就发生了隐睾症。究其原委，主要有以下几个因素：
(1)解剖因素 包括①在胚胎期，睾丸系带很短或缺如，不允许睾丸充分下降。②睾丸系膜与腹膜发生粘连，使睾丸无法向下。③睾丸的血管发育异常，弯曲或皱折，从上方牵拉而限制睾丸下降。④精索的血管或输精管太短。⑤睾丸体积过大，腹股沟管过紧或外环远端进入阴囊的口缺乏，则睾丸无法进入阴囊内。⑥阴囊发育异常，阴囊太小，容不下睾丸。
(2)内分泌因素 睾丸下降要有足够的动力，那就是要依靠母体的促性腺激素刺激胎儿睾丸间质细胞产生雄激素，故：①睾丸本身有缺陷时，对促性腺激素不产生下降反应而发生隐睾；②因睾丸下降发生在血液中促性腺激素浓度很高时，所以当母体促性腺激素匮乏，也会导致睾丸下降不全。
(3) 遗传因素 有部分隐睾病人有明显家族史，故遗传因素也许是隐睾发生原因之一。或许还有其他一些原因导致隐睾的发生，预计随医学水平的不断提高，些原因会一一明朗化，从而找出有效的防治方法，阻止这种疾病的发生。
