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该院于1906年初建，为德国的一个临时检疫所。1914年11月被日本陆军病院接管。1918年6月改为广岛町分院台西镇传染病分室。1920年3月改为青岛病院台西镇分院。1922年12月，由北洋政府胶澳商埠督办公署接管，改名为胶澳商埠传染病院。1925年10月，划归山东省总督署卫队军医处，改称市民传染病院。1928年6月军医处撤退，恢复胶澳商埠传染病院名称。1929年命名为青岛市市立传染病院。1931年改为青岛市市立医院第一分院。1933年7月，又称青岛市市立传染病院。1938年1月，再次被侵华日军当局占用，由日本同仁会防疫处兼管。1945年12月由青岛市卫生委员会接管。1946年3月移交青岛市卫生局。1958年8月由嘉祥路迁现址。1979年10月17日改称青岛市传染病医院。为传染病专科防治医院。
1986年，全院占地35673平方米，建筑面积9436平方米。病床400张，病床使用率71.7％。职工274人，其中卫生技术人员196人，主任、副主任医师各1人。医生与护士之比为1:1.6，病床与职工之比为1:0.68。日均门诊量58人次。医疗科室有4个病室（其中设有肝炎、外轮及港口留检、干部病床），医技科室有药剂科、检验科、超声波室、Ｘ光室等、还有6个管理科室。主要仪器设备有500毫安Ｘ光机、Ｂ型超声诊断仪、人工肾机和钾钠分析仪等。
该院承担传染病的医疗、教学、预防及科研任务。根据《中华人民共和国急性传染病管理条例》规定，收治法定传染病人。30多年来，为消灭天花，控制烈性传染病的发病做出重大贡献，使青岛市的传染病发病率与死亡率大幅度下降。
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