⑷5-羟色氨酸（5-HT）：5-HT能神经元以色氨酸为原料，在色氨酸羟化酶及5-羟色氨酸脱羧酶作用下合成5-HT。色氨酸羟化酶特异性较高，只存在于5-HT能神经元中，且含量少，活性较低，是合成5-HT的限速因子。5-HT贮存于囊泡中，释放后被再摄取及MAO降解而终止作用。5-HT主要经MAO灭活生成5-羟吲哚乙酸（5-HIAA），而在松果体内，5-HT经羟基吲哚氧位甲基移位酶（HIOMT）及芳香烃胺氮位甲基移位酶（AANMT）作用生成黑色紧张素（褪黑素），后者能抑制垂体促性腺激素的分泌。5-HT能神经元胞体位于低位脑干中线附近的中缝核。认为脑内有三种5-HT对大脑表现抑制性影响与睡眠有关，当脑内5-HT减少时则出现失眠。中枢5-HT有提高痛阈作用，具有镇痛功能。脑内5-HT与情绪和精神活动有关，当脑内5-HT代谢失调，可导致智力障碍和精神症状，近年发现精神分裂症病人脑脊液中存在5-甲氧色胺（5-MT），当给予大量蛋氨酸作为甲基供体，可加重精神分裂症状。急性青春型和其它急性兴奋型精神病，其血液5-HT含量显著低于健康人，5-HT水平低下者有自杀意念。这些表明5-HT有助于维持精神、情绪的稳定，中枢5-HT功能不足是情绪紊乱的体质因素。脑发育不全，智力愚钝患者，血中5-HT含量较低，这可能由于苯丙氨酸过多，抑制色氨酸羟化酶，使5-HT合成减少所致。脑内5-HT有抑制肾上腺激素分泌和黄体生成素的分泌，促进催乳素的分泌，说明5-HT与性激素、性行为有关。
⑸组胺（HA）：HA系氨基酸脱羧生成。主要分布于丘脑、乳头体和视上核，脑内合成的HA贮存于神经元和肥大细胞内。在肥大细胞内组胺与肝素、碱性蛋白硫酸多糖形成复合物，此种形式的组胺更新缓慢，神经元内组胺更新较快。组胺主要在组胺-N-甲基转移酶作用下生成甲基组胺，再经MAO作用转化为3-甲基咪唑乙酸。中枢神经系统中HA能神经元集中在下丘脑、中脑、纹状体及黑质。脑内HA受体分为H1和H2两型，H1型激动时产生兴奋效应，H2型激动时则产生抑制效应。此外还有H3受体，很可能是神经末梢的自身受体，抑制HA的释放。直接向脑室注射HA，可出现血压升高、心率加快、体温下降及促进抗利尿激素的分泌，外周H1型受体兴奋使支气管、肺动脉、小动脉的平滑肌松弛，引起扩张血管作用。保持锥体外系神经功能的正常有赖于DA和Ach能神经元及5-HT和HA能神经元这两个系统的动态平衡，DA及5-HT能神经元为抑制性神经元，而Ach能及HA能神经元为兴奋性神经元，两体系失衡可引起锥体外系疾病，如帕金森症。
⑹γ-氨基丁酸（GABA）：中枢GABA的合成部位在神经末梢。谷氨酸经谷氨酸脱羧酶（GAD）作用生成GABA。GABA合成后与线粒体膜或突触体膜结合而贮存。释放的GABA经再摄取而终止其作用，在GABA转氨酶作用下脱氨基生成琥珀酸半醛，后者经琥珀酸半醛脱氢酶作用生成琥珀酸，而进入三羧酸循环被彻底氧化。GABA主要分布于脑灰质内，尤以黑质、苍白球含量最高。已知GABA受体有两种亚型：GABA-A型受体，在小脑集中于颗粒细胞层，为突触后膜上的受体；GABA-B型受体，主要集中于小脑胶质细胞，为突触前受体。GABA是中枢皮层的主要抑制性递质，对所有神经元都呈抑制作用，睡眠时皮层释放GABA增加。癫痫发作的强度与大脑皮层内GABA含量降低程度一致，基底神经节中GABA降低与帕金森综合征及亨延顿舞蹈病（Huntington disease，HD）有关。GABA降低，使抑制性神经冲动不足，DA功能亢进，可促发精神分裂症。
⑺谷氨酸（Glu）：脑内谷氨酸和天冬氨酸含量很高，对神经元有极强的兴奋作用，是兴奋性递质。谷氨酸在脊髓中特异性分布，即背根高于腹根，而天冬氨酸腹根高于背根，故认为谷氨酸是初级传入纤维的兴奋性递质，天冬氨酸是中间神经元兴奋性递质。脑内存在一个神经末梢与胶质细胞谷氨酸循环轮回系统，神经胶质细胞内含有谷氨酰胺合成酶，它能将从突触间隙摄取的谷氨酸转化成谷氨酰胺，后者可转运到神经末梢中，经谷氨酰胺酶脱氨生成末梢内的谷氨酸，在神经兴奋时释放至突触间隙起递质作用。谷氨酸受体以不同激动剂来分，有海人藻酸受体（KA-受体）、使君子氨酸受体（QA-受体）及N-甲基-D-天冬氨酸受体（NMDA-受体）。目前还有的提出谷氨酸的代谢性受体，为跨膜蛋白核成员，与G蛋白有关，这类受体可激活磷脂酶C，产生肌醇三磷酸（IP3），使Ca2+从神经胞内钙池流出，影响神经元的兴奋性。也有人认为QA受体和KA受体的功能与动物的定位、学习能力、嗅觉的学习有关。谷氨酸和天冬氨酸几乎对所有的神经元都有兴奋作用，其特点是作用快、消失快。脑内谷氨酸和谷氨酰胺的转化是对NH3的解毒作用。谷氨酸也能促进脑组织合成乙酰胆碱、GSH及推动脑内糖的有氧氧化。兴奋性氨基酸的代谢紊乱和在神经组织中的积聚可通过兴奋性作用引起脑组织损伤，尤其是谷氨酸的神经毒性可能与人类某些神经系统疾病如：早老性痴呆和亨延顿病中出现的神经退化相关。谷氨酸是味精的主要成分，自60年代末报道有其神经毒性作用以来，对食用味精是否安全的问题一直存在争论，某些外国人食用味精后出现某些异常反应，从而在国外提出“中国餐馆综合征”的概念，争论并未解决，仍待深入研究。
⑻内啡肽和脑啡肽：内啡肽早先称为内原性鸦片样物质（EOLS），现已知EOLS包括内啡肽和脑啡肽，其受体与鸦片受体共存。内啡肽主要存在于脑和垂体中，为大分子的吗啡样肽，有α-、β-、γ-和δ-内啡肽四种，其中以α-和β-内啡肽（前者为16肽，后者为31肽）较重要。β-内啡肽与蛋氨酸脑啡肽共存于β-脂酸释放激素（β-LPH）中。脑啡肽分为蛋氨酸脑啡肽（H-酪-甘
